La ZSC ospita alcune specie rarissime nella flora valtellinese come Asperula purpurea, che si trova su pendici calde e assolate poco sotto al limite inferiore della ZSC, Corydalis cava nei boschi di faggio poco sotto al limite inferiore della ZSC, Daphne laureola nei boschi caldi al limite inferiore della ZSC, l'orchidea Orchis sambucina e la bellissima Tulipa australis su prati magri e ben esposti. Il vischio (Viscum album) è raro e si trova sul pino silvestre nella parte ovest della ZSC. Nella ZSC è segnalato Laserpitium krapfii, una specie endemica che vegeta sui ghiaioni.